學院成立以來，緊密圍繞國家和地方重大需求，解決海洋生态文明和海洋強國建設過程中有關海洋動力過程的關鍵科學問題。參與并組織編寫首次《第一次海洋與氣候變化科學評估報告》。立項科研項目共257項，合同經費9950.37萬元，到賬經費8626.71萬元，其中國家重點研發計劃課題4項、國家自然科學基金70項（含1項極地專項重點項目、1項重點項目和1項優青項目）、江蘇省自然科學基金34項、國家博士後科學基金15項（含2項特别資助）、江蘇省博士後科研資助計劃3項。發表SCI論文277篇，其中二區以上的論文143篇（占比51.62%）、軟件著作權8項，授權發明專利4項，授權實用新型專利8項，授權澳大利亞革新專利1項，牽頭獲得2021年度大禹水利科學技術獎三等獎1項。舉辦“海洋環境與氣候變化學術研讨會”“極地氣候和極端事件國際研讨會”等26次學術研讨會、1次物理海洋學系列講座、2次國際青年學者論壇、1次國際夏季講習班、1次江蘇省研究生學術創新論壇及2兩次專題交流會。